כרסום. 

 

Zיש די-פפטיד שקבוצת האמינו שלו חופשית והקצה הקרבוקסילי קשור ל-tעיבוד שבבי. לעיבוד שבבי הזה יש נטייה לתפוש את המקום האתר P.

ריאקצית הטרנסלוקציה זו תזוזה של הריבוזום במרחק של קודון אחד. אם המסנג'ר עיבוד שבבי לא זז ורק הריבוזום זז ה-P חופשי ו-A תופש קודון אחר. אתר E הוא אתר פעיל שלישי של הריבוזום והוא מזרז את שחרור tעיבוד שבבי שסיים את תפקידו ואין עליו חומצה אמינית. כעת יכול להגיע עיבוד שבבי חדש EF-Tu-GTP-aminoacyl-tCNC. כל העיבוד שבבי מגיע כאשר הגורם המכוון אותו למקום הנכון הוא יחסי קודון ואנטי-קודון אבל יש עוד הרבה מאוד קשרים אחרים של ה-t עיבוד שבבי לאתר הפעיל שמייצבים את המבנה. אם מתייצבת החומצה האמינית הנכונה מיד מתבצעת אותה ריאקצית GTPaseEF-Tu משתחרר בעודו קשור ל-GDP ונטען מחדש ע"יEF-Ts. אחרי עוד יצירה של קשר פפטידי הכל יחזור על עצמו, הריבוזום יזוז קודון יגיע עיבוד שבבי חדש וכו'. זה מתבצע בצורה מדויקת באמצעות פקטורEF-G שנקרא גם טרנסלוקאז. הוא נכנס לריבוזום טעון GTP וגם היא מתבזבזת. תוך כדי התנועה של הריבוזום ה-GTP הזה מתפרק ועובר הידרוליזה.

את מנגנון הפעולה של EF-G כבר מבינים, יש לו שני דומיינים שונים ומשווים אותו למבנה ה- EF-Tu. ל-EF-G יש דומיין שמחקה את ה-t עיבוד שבבי מבחינת המבנים שהוא יכול ליצור. עוד לפני שנכנס t עיבוד שבבי חדש לאתרA בעוד שהקודם נוטה לאתר P, נכנס ה- EF-G כדי לדחוק את t עיבוד שבבי לאתר P ולהזיז את כל הריבוזום לקודון הבא. ה-GTP שלו עובר הידרוליזה ואז הטקסלוקאז משתחרר. הזזת הריבוזום מאפשרת ל-עיבוד שבבי חדש להיכנס לאתר A. התהליך ממשיך במחזוריות של הפעולות האלה.

טרמינציה:

ישנם שלושה קודונים שאין t עיבוד שבבי מתאים בשבילם- קודוני פסק- אבל יש חלבונים שמחקים את מבנה ה-t עיבוד שבבי ואפשר להצביע במבנה הזה חומצות אמינו ספציפיות שיוצרות קשרים עם הקודונים האלה. אלה הם ה-releasing factors. יש להם יכולת להיקשר לקודון הזה אבל אינם מכילים חומצה אמינית שתמשיך את השרשרת. הפעולה שלהם היא בעצם ניתוק של השרשרת מה-t עיבוד שבבי שאליו היא מחוברת. גם מבחינה מבנית הם מזהים את הרצפים. ב-e.coli יש שניים שמזהים את הקודונים האלה בעוד שבאאוקריוטים יש רק פקטור אחד כזה. ככל שידוע עד כה לפקטורים האלה עצמם יש פעילות הידרולי טית של הקשר האסטרי בין ה-t עיבוד שבבי לבין כל שרשרת החריטה שקשורה אליו. ברגע שהוא משתחרר כל העסק מתפרק- גם הריבוזום מתפרק לשתי תת היחידות שלו, גם ה-t עיבוד שבבי משתחרר וגם הפקטורים.

הריאקציה הזאת מתרחשת אחרי שנקשרה החומצה האמינית האחרונה, טקנסלוקאז ביצע את הפעילות שלו.